Struktur Organisasi RSUD Panembahan Senopati Bantul :
Direktur
1. Kelompok
a. Jabatan Fungsional
b. Komite-komite
c. SPI
2. Wakil Direktur Pelayanan dan Penunjang
a. Bidang Pelayanan Medik dan Penunjang
- Seksi Pelayanan Medik Penunjang dan Bedah Sentral
- Seksi Rawat Inap, Rawat Jalan dan Gawat Darurat
b. Bidang Penunjang Medik
- Seksi Penunjang Klinik
- Seksi Penunjang Non Klinik
c. Bidang Keperawatan dan Mutu
- Seksi Keperawatan dan Kebidanan
- Seksi Mutu dan Audit Klinik
3. Wakil Direktur Umum dan Keuangan
a. Bagian Pengembangan
- Sub Bag Pendidikan dan Penelitian
- Sub Bag Hukum, Pemasaran dan Kemitraan
b. Bagian Keuangan
- Sub Bag Perbendaharaan dan Aset
- Sub Bag Verifikasi dan Akuntansi
c. Bagian Umum
- Sub Bag Umum dan Kepegawaian
- Sub Bag Program